Leon Phokas der Jüngere war mit einer Frau verheiratet, deren Namen und Herkunft nicht bekannt sind. Eheliche Kinder Leons:
Nikephoros Phokas (* um 940, † nach 989), Patrikios
Bardas Phokas der Jüngere (* um 940, † 13. April 989 in Abydos), 978 Domestikos ton scholon, wurde 970 und 987 zum Gegenkaiser von Byzanz ausgerufen
Sophia Phokaina (* um 945) ∞ Konstantinos Skleros (* um 920, † 991), Schwager des Kaisers Johannes Tzimiskes