Kuno was getrouwd met Mathilde van Achalm (ca. 1040 - 30 september 1092/1094), die na haar man is overleden. Kuno en Mathilde kregen de volgende kinderen:
Hendrik, gesneuveld in de Slag bij Mellrichstadt, vader van Hendrik van Lechsgemünd en Frontenhausen en van Otto van Möhren
Otto van Horburg, graaf aan de Naab
Kuno van Horburg, gehuwd met Irmgard van Rott (weduwe van Gebhard II van Sulzbach), ouders van Kuno en Koenraad
Burchard van Lechsgemünd
Berthold, gehuwd met Beatrix van Dachau, medestichter en voogd van het klooster in Eisenhofen an der Glonn. Ouders van Burkhard en Helika.
mogelijk Mathilde gehuwd met Frederik van Tengling graaf van Peilstein, wiens zoon Koenraad trouwde met Adela de dochter van Siegfried I van Weimar-Orlamünde
Adelheid (ovl. 24 februari 1108), gehuwd met Marward van de Chiemgau (vermoord, geen kinderen), daarna met Ulrich van Passau (dochter Uta, gehuwd met Engelbert van Karinthië), daarna met Berengar van Sulzbach (geen kinderen)
mogelijk Emma, gehuwd met Udalschalk van de Lurgau
